为方便运输和用户，每个航班均编有航班号。
中国国际航班的编号是由执行该航班任务的航空公司的二字代码和三个阿拉伯数字组成，其中最后一个数字为奇数者，表示去程航班，最后一个数字为偶数者，表示回程航班。
如MF801则指厦门航空有限公司承担的自武夷山至香港的地区航班。
中国国内航班的航班号由执行航班任务的航空公司二字代码和四个阿拉伯数字组成，其中第一位数字表示执行该航班任务的航空公司或所属管理局，第二位数字表示该航班终点站所属的管理局，第三、四位数字表示班次，即该航班的具体编号，其中第四位数字若为奇数，则表示该航班为去程航班，若为偶数，则为回程航班。
例如：CA1805，表示由中国国际航空公司担任的由北京至武夷山的去程航班，MF8804，是指厦门航空有限公司担任的由武夷山至厦门的回程航班。
中国部分航空公司二字代码及中国民航各管理局代号
华北管理局 1
西北管理局 2
广州管理局 3
西南管理局 4
华东管理局 5
沈阳管理局 6
中国国际航空公司 CA 1
中国西北航空公司 WH 2
中国南方航空公司 CZ 3
深圳航空公司 ZH 3
中国西南航空公司 SZ 4
四川航空公司 3U 4
云南航空公司 3Q 4
中国东方航空公司 MU 5
上海航空公司 FM 5
中国北方航空公司 CJ 6
中国通用航空公司 GP 7
厦门航空有限公司 MF 8
新疆航空公司 XO 9
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